甜菜碱对人体健康具有非常重要的作用。甜菜碱作为高效的甲基供体，直接参与蛋氨酸循环；甜菜碱也可提高甜菜碱-同型半胱氨酸甲基转移酶的活力，提供充足的甲基，促进蛋白质合成；同时，甜菜碱也能促进动物体内卵磷脂的合成、降低肝脏中脂肪生成酶的活力、促进载脂蛋白的合成。

甜菜碱能够维持s-腺苷甲硫氨酸（SAM）和s-腺苷高半胱氨酸（SAM:SAH）比例，并通过转甲基作用促进磷脂酰乙醇胺形成卵磷脂，提高极低密度脂蛋白（VLDL）的含量，而VLDL能将脂类由肝脏运送至全身各组织从而减少脂类在肝脏的堆积，保护肝脏功能。Abdelmalek等随机对照研究了55 例非酒精性脂肪肝患者，34例患者治疗后行肝组织活检，发现口服甜菜碱组患者（20g/d）肝脂肪变性程度较对照组有改善。

孕产妇的甲基基团的供给从受孕到胎儿娩出整个阶段具有十分重要的意义。高浓度同型半胱氨酸可能与先兆子痫、胎儿早产、低体重儿、胎儿生长受限有关，在20周前母体血浆甜菜碱浓度是同型半胱氨酸的预测器。Shaw等对照研究发现，母体摄入丰富的胆碱、甜菜碱和蛋氨酸的食物能降低发生胎儿神经管畸形的风险性。因此，在整个妊娠期甜菜碱的摄入对母体和胎儿的健康起着重要作用。

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