甜菜碱通过促进体内磷脂的组成，一方面下降了肝脏中脂肪组成酶的活性，另一方面又促进了肝脏中载脂蛋白的组成，促进了肝中脂肪的搬迁，下降了肝脏中甘油三酯的含量，有效地防止了肝中脂肪蓄积。并通过促进脂肪的分化和抑制脂肪的组成两层效果来下降体脂的堆积。

甜菜碱在肉牛饲料中添加可以改进动物肠道张力，而热应激等不利因素会导致动物肠道弹性变差。当环境温度升高时，血液会优先流向皮肤以利于散热。这会导致流向胃肠道的血液削减，这反过来又会影响消化以及下降养分的消化率。

应激会导致肠道结构改变，假如不加以控制的话，进而会下降肠道的收缩才能。天然态甜菜碱对动物的肠道结构和免疫系统会发生有益的效果。其对维持动物肠道完整性的有利效果可以保护动物免受肠道内其他不良微生物增殖引发的脱水环境，而脱水可能会危害动物的生产性能。
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